本书系统介绍了使用 treeio、tidytree、ggtree 和 ggtreeExtra 等R包操作系统发育树的全套流程，包括对树文件的解析，以及树与其相关数据的操作、整合、可视化等内容。
本书由余光创撰写，旨在为系统发育树的操作与呈现提供指导。如果读者需要进行系统发育树的相关操作，却又觉得无从下手，那么这本书会提供很大的帮助。关于系统发育树的大部分问题，都能在本书中找到答案。
作者简介:
余光创，毕业于香港大学公共卫生学院，获得生物信息学博士学位。南方医科大学基础医学院教授，现任生物信息学系系主任。连续两年（2020-2021）入选爱思唯尔中国高被引学者，入选全球前2%顶尖科学家榜单“年度科学影响力”排行榜（2020-2022）和“终身科学影响力”排行榜（2021-2022）。
目录:
第1章 导入带有数据的树文件 .2
第2章 操作含有关联数据的树 .38
第3章 导出含有数据的树 67
第4章 系统发育树可视化 80
第5章 系统发育树注释 107
第6章 系统发育树的可视化探索 .122
第7章 绘制含有数据的树 134
第8章 使用轮廓图和子图注释进化树 148
第9章 对其他树形对象使用 ggtree 包 .162
第10章 使用 ggtreeExtra 包在环形布局上呈现数据 175
第11 章 其他 ggtree 扩展包 .192
第12 章 ggtree 包中的实用工具 .198
第13章 可重复示例图库 213
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